RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552596.1

MCRS1-215, Transcript of microspherule protein 1, human

TSL 2

Gene MCRS1, Length 669 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCRS1-215	ENST00000552596	POU3F4	P49335	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	IL24	Q13007	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GPR157	Q5UAW9	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GAFA1	Q96PS6	74 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DUX4	Q9UBX2	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596		A0A1W2PQ09	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZFPL1	O95159	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	HCK	P08631	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	AMY2B	P19961	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	BLMH	Q13867	455 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CCDC58	Q4VC31	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CALHM1	Q8IU99	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	WDFY2	Q96P53	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596		H0YJX3	145 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	VENTX	O95231	258 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CD2	P06729	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SELL	P14151	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	MPZ	P25189	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SOX2	P48431	317 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	PDCD1	Q15116	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DGUOK	Q16854	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	LHX4	Q969G2	390 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	MYL12B	O14950	172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	KNG1	P01042	644 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	FSHB	P01225	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SFTPB	P07988	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CHRM2	P08172	466 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	AQP4	P55087	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CAV3	P56539	151 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	BAMBI	Q13145	260 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596		Q8IYB0	196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ZNF561	Q8N587	486 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	CD177	Q8N6Q3	437 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	GPER1	Q99527	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCRS1-215	ENST00000552596	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms