RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	PTGDS	P41222	190 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SERPINB10	P48595	397 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC25A1	P53007	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FBXW4	P57775	412 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ERVK-25	P63136	954 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	BDH1	Q02338	343 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PON3	Q15166	354 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	QPRT	Q15274	297 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T27	Q8NH04	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR4K13	Q8NH42	304 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MCFD2	Q8NI22	146 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF563	Q8TA94	476 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	M1AP	Q8TC57	530 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FANK1	Q8TC84	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM234	Q8WY98	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	BORCS5	Q969J3	196 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	C8orf44	Q96CB5	159 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		Q96M85	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NMNAT3	Q96T66	252 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	COQ7	Q99807	217 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MED18	Q9BUE0	208 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NANS	Q9NR45	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1B0GVG6	124 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM72	A0PK05	275 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908		C9J4A7	227 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PLPP3	O14495	311 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SH2D1B	O14796	132 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	MYL12B	O14950	172 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF208	O43345	1280 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR2T1	O43869	369 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR2J2	O76002	312 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	STK17B	O94768	372 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	COX6A1	P12074	109 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ICAM2	P13598	275 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF3	P17036	446 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CEL	P19835	753 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RORC	P51449	518 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	HCCS	P53701	268 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	FABP5	Q01469	135 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NAAA	Q02083	359 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF85	Q03923	595 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZP4	Q12836	540 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	CARTPT	Q16568	116 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF404	Q494X3	552 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR6V1	Q8N148	313 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RPS13-208	ENST00000531908	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		3.87	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms