RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531842.1

USF1-210, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene USF1, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-210ENST00000531842 DLX6P56179 175 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 CDK5Q00535 292 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 AANATQ16613 207 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 CEP78Q5JTW2 689 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 CASC10Q5T4H9 136 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 FAHD1Q6P587 224 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 SPATA24Q86W54 205 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 COMMD2Q86X83 199 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 OR2T27Q8NH04 317 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ZNF649Q9BS31 505 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.16□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 VGLL3A8MV65 326 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ODF3BA8MYP8 253 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ZNF732B4DXR9 585 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 E9PQ18 207 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 GNGT2O14610 69 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 SELENOFO60613 162 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 FAHP16930 419 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 SLC2A5P22732 501 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 EFNB1P98172 346 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 GK3PQ14409 553 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 GINS1Q14691 196 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 OTOSQ8NHW6 89 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 TEX12Q9BXU0 123 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USF1-210ENST00000531842 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 A0A1W2PPH5 198 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 PRR32B1ATL7 298 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 H3BNX3 289 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 M0R129 80 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 F2RL2O00254 374 aa7.14□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 AMY2AP04746 511 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 HMGN1P05114 100 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 OSMP13725 252 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 MAP2K3P46734 347 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 GNG3P63215 75 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 SLC34A1Q06495 639 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ATP6AP1Q15904 470 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 MOB3CQ70IA8 216 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 TCF23Q7RTU1 214 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ZNF329Q86UD4 541 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 SDSLQ96GA7 329 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 OR51I2Q9H344 312 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 NIPAL2Q9H841 368 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.14□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.14□□□□□ -1.27
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USF1-210ENST00000531842 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 A0A1W2PPE2 198 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 A0A1W2PR64 198 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 A0A1W2PRV1 198 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 FAM172BPA6NC97 362 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 CCDC182A6NF36 153 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 H0YHG0 523 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 C3orf84H3BNL1 204 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 SLC1A7O00341 560 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 E2F6O75461 281 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 MMP23AO75900 390 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 INMTO95050 263 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 ANXA8P13928 327 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 HCCSP53701 268 aa7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USF1-210ENST00000531842 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.13□□□□□ -1.27
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