RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TDP2O95551 362 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SOD1P00441 154 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SHBGP04278 402 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FGF1P05230 155 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CDK1P06493 297 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC175P0C221 793 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GSTT2P0CG29 244 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GSTT2BP0CG30 244 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UQCRBP14927 111 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC2A5P22732 501 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL3RAP26951 378 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAP3K8P41279 467 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAGEA2P43356 314 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCL11P51671 97 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AQP4P55087 323 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITIH4Q14624 930 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LINC00303Q3SY05 128 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USH1GQ495M9 461 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HES3Q5TGS1 186 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPATA1Q5VX52 437 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CST9LP1Q5W188 147 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRIM40Q6P9F5 258 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SZRD1Q7Z422 152 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GALNT10Q86SR1 603 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CYP4Z1Q86W10 505 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LHFPL1Q86WI0 220 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM17Q86X19 198 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF619Q8N2I2 560 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C17orf78Q8N4C9 275 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF555Q8NEP9 628 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR4A16Q8NH70 328 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RXFP4Q8TDU9 374 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMCR5Q8TEV8 140 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PYROXD1Q8WU10 500 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC29Q8WV35 223 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DCAKDQ8WVC6 231 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UFD1Q92890 307 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C10orf35Q96D05 121 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARL6Q9H0F7 186 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HSD3B7Q9H2F3 369 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IL36GQ9NZH8 169 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UNC13BO14795 1591 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SACSQ9NZJ4 4579 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A0G2JMP0 313 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A0X1KG70 313 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DPRXA6NFQ7 191 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMIM9A6NGZ8 99 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C9JQL5 133 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RGS5O15539 181 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC37A4O43826 429 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ORC5O43913 435 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NME2P1O60361 137 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTNSO60931 367 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 S100BP04271 92 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RLN1P04808 185 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GUSBP08236 651 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 H2BFMP0C1H6 154 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C8orf89P0DMQ9 161 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GTF2F2P13984 249 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NQO1P15559 274 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS3P35030 304 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HSD17B2P37059 387 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CASP4P49662 377 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TAS2R46P59540 309 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC35A2P78381 396 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCZ1BP86790 482 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NAB1Q13506 487 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAB31Q13636 194 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR8G1Q15617 311 aa-1.64□□□□□ -2.67
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