RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM151BQ6UXP7 276 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 VN1R4Q7Z5H5 301 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 NT5DC3Q86UY8 548 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OOSP2Q86WS3 158 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PCP2Q8IVA1 136 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF321PQ8N8H1 164 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8N976 141 aa1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR5T3Q8NGG3 340 aa1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C4Q8NGS5 318 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C2Q8NGS9 318 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CD300LFQ8TDQ1 290 aa1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 IFI27L2Q9H2X8 130 aa1.96□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 WDR54Q9H977 334 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP1.96□□□□□ -2.11e-12■■■■□ 21.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL5AQ9Y689 179 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CADP27708 2225 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIAL4EA0A075B759 164 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC5A10A0PJK1 596 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 MGAT4DA6NG13 374 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 GABRR3A8MPY1 467 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 C17orf51A8MQB3 221 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 C9J4A7 227 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R2P9O14990 202 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ANGPTL7O43827 346 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OR1I1O60431 355 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM8O95777 96 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CT62P0C5K7 136 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIAL4FP0DN26 164 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF823P16415 610 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 KITLGP21583 273 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 TFPI2P48307 235 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A25Q6KCM7 469 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFAF7Q7L592 441 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SAXO1Q8IYX7 474 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2J2Q8N2K1 259 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 STPG2Q8N412 459 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 MREGQ8N565 214 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10G2Q8NGC3 310 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM54Q969K7 222 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 CAPZA3Q96KX2 299 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa1.95□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OLFM3Q96PB7 478 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 ANP32EQ9BTT0 268 aa1.95□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP1.94□□□□□ -2.1
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RABGGTB-211ENST00000489450 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 AGTP01019 485 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 FGGP02679 453 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPIND1P05546 499 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 TLX1NBP0CAT3 122 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM10L1P0DMW3 83 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 OMGP23515 440 aa1.94□□□□□ -2.1
RABGGTB-211ENST00000489450 CCR7P32248 378 aa1.94□□□□□ -2.1
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