RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	BLVRA	P53004	296 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	BDH1	Q02338	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HES4	Q9HCC6	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390		J3QT63	122 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GSTA4	O15217	222 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF737	O75373	536 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GYPB	P06028	91 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	C7orf34	Q96L11	122 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CMTM6	Q9NX76	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DIRAS1	O95057	198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SPI1	P17947	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	IFNGR2	P38484	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CEACAM3	P40198	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SMIM11A	P58511	58 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LIPE	Q05469	1076 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	AMELY	Q99218	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NIPAL2	Q9H841	368 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	GADD45G	O95257	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	HAAO	P46952	286 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CRMP1	Q14194	572 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SHF	Q7M4L6	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF573	Q86YE8	665 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	STPG2	Q8N412	459 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CCRL2	O00421	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	MMP23A	O75900	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	HCK	P08631	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	CLU	P10909	449 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	MNDA	P41218	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	KLF10	Q13118	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	FHL3	Q13643	280 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SHOC2-205	ENST00000489390	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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