RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.21□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.21□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 FZR1Q9UM11 496 aa9.21□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 VSTM5A8MXK1 200 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 H7C417 338 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MFNGO00587 321 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SYNGR1O43759 233 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ORC5O43913 435 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ZG16O60844 167 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 C1QL1O75973 258 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PTTG1O95997 202 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PLATP00750 562 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CD3EP07766 207 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ADH4P08319 380 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CD3GP09693 182 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 BCL3P20749 454 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PRSS3P35030 304 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 NPBWR2P48146 333 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 FGF12P61328 243 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ERVK11-1P61568 191 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ZNF154Q13106 437 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MAB21L1Q13394 359 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ADIPOQQ15848 244 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CDNFQ49AH0 187 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZNX1 250 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZTK2 550 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 OSR2Q8N2R0 312 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 POC5Q8NA72 575 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SEH1LQ96EE3 360 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PLK3Q9H4B4 646 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MSL2Q9HCI7 577 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DUSP13Q9UII6 198 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 HSF4Q9ULV5 492 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.2□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 MEIOCA2RUB1 952 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SOCS1O15524 211 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SIAH2O43255 324 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 LPLP06858 475 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PGA5P0DJD9 388 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PTHLHP12272 177 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 GDNFP39905 211 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PMELP40967 661 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DYRK1AQ13627 763 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 IL13RA2Q14627 380 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 VHLLQ6RSH7 139 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 LINC00596Q86U02 117 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 Q8IYB0 196 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CHST4Q8NCG5 386 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 OR10AD1Q8NGE0 317 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ST8SIA4Q92187 359 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SLAMF9Q96A28 289 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 RAB3CQ96E17 227 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SYT3Q9BQG1 590 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PECRQ9BY49 303 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 KCNK7Q9Y2U2 307 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 CADP27708 2225 aa9.19□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 PLSCR5A0PG75 271 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 TMEM235A6NFC5 223 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 SERPINE3A8MV23 424 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 E7EQL1 145 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 F5H5P2 479 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 F8VVB4 439 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 F8VWA3 439 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 H3BUI4 141 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 LYRM1O43325 122 aa9.18□□□□□ -0.94
OPTN-211ENST00000486862 RBBP9O75884 186 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms