RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	NSMAF	Q92636	917 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	LHX4	Q969G2	390 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR2V2	Q96R30	315 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	MBD2	Q9UBB5	411 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936		A0A1B0GWA3	101 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936		E9PQ18	207 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936		K7EIL1	84 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PLPP3	O14495	311 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	KDM4B	O94953	1096 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	C1QC	P02747	245 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CRYGC	P07315	174 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CHRNG	P07510	517 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PRKACA	P17612	351 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	LBP	P18428	481 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SERPINB5	P36952	375 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	EMX2	Q04743	252 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	CASP8	Q14790	479 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	KCNJ8	Q15842	424 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SSX2	Q16385	188 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SGCA	Q16586	387 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936		Q75L30	129 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	RNF148	Q8N7C7	305 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR6S1	Q8NH40	331 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	TESC	Q96BS2	214 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	NEK6	Q9HC98	313 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CEP170-209	ENST00000464936	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	SMIM23	A6NLE4	172 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	C5orf58	C9J3I9	102 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	DVL1	O14640	695 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	HDAC3	O15379	428 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	MGRN1	O60291	552 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	KRT36	O76013	467 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	OR5F1	O95221	314 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	ANP32D	O95626	131 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	TOMM40	O96008	361 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	APOA1	P02647	267 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	BGLAP	P02818	100 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CEP170-209	ENST00000464936	SHBG	P04278	402 aa		3.65	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms