RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411767.6

PTPN13-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN13, Length 8,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13-202ENST00000411767 OR51H1Q8NH63 302 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 HGDQ93099 445 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 NOX4Q9NPH5 578 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 CD84Q9UIB8 345 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 A0A1B0GWA3 101 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 METRNQ9UJH8 293 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 ALG14Q96F25 216 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 GALP22466 123 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 CBLN1P23435 193 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 FUT5Q11128 374 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 TSPAN31Q12999 210 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPN13-202ENST00000411767 BIVMQ86UB2 503 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPN13-202ENST00000411767 SLC25A38Q96DW6 304 aa4.12□□□□□ -1.75
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