RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 PMP22Q01453 160 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 AAMDCQ9H7C9 122 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF17P17021 662 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 LPAR6P43657 344 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 AVPI1Q5T686 147 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 OR2M3Q8NG83 312 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 MRGPRDQ8TDS7 321 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 IL36GQ9NZH8 169 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 BRS3P32247 399 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 MED30Q96HR3 178 aa22.2■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa22.2■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 IGHV3-43DP0DP04 118 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 HRKO00198 91 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 TMPRSS2O15393 492 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 OR2D2Q9H210 308 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 H3BP45 60 aa22.19■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 CDC42EP2O14613 210 aa22.19■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OR8B12Q8NGG6 310 aa22.19■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM147Q9BVK8 224 aa22.18■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC25A32Q9H2D1 315 aa22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 FUCA1P04066 466 aa22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 V9GYS6 101 aa22.18■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PN81 502 aa22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa22.18■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 OR4A8P0C604 315 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 SRRQ9GZT4 340 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OR3A1P47881 315 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ASCL1P50553 236 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 OR5AP2Q8NGF4 316 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 SP9P0CG40 484 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPIRE1-202ENST00000409402 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 GSX2Q9BZM3 304 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 RNF7Q9UBF6 113 aa22.17■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 FOXS1O43638 330 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OXA1LQ15070 435 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 BAP18Q8IXM2 172 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 TMED3Q9Y3Q3 217 aa22.16■■□□□ 1.14
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