RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296328.8

UBXN7-201, Transcript of UBX domain protein 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN7, Length 10,568 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7-201ENST00000296328 RAB32Q13637 225 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FBXO24O75426 580 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZBTB25P24278 435 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ACKR3P25106 362 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 HIST3H3Q16695 136 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FAM166AQ6J272 317 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CHST5Q9GZS9 411 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TPPPO94811 219 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 C3orf80F5H4A9 247 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 DKK1O94907 266 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CLLU1Q5K131 121 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 GSX2Q9BZM3 304 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 HRH4Q9H3N8 390 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 MPTX1A8MV57 137 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TOR1AO14656 332 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 LDLRAD4O15165 306 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CBR1P16152 277 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 H3F3AP84243 136 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 RDH5Q92781 318 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 WNT2BQ93097 391 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 WRBO00258 174 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TUSC2O75896 110 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 PRH1P02810 166 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 PRF1P14222 555 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 PSMB6P28072 239 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CEBPGP53567 150 aa4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 LINC00862A6NCI5 91 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 HGFACQ04756 655 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 BEND4Q6ZU67 534 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 HOGA1Q86XE5 327 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 EXTL1Q92935 676 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF75AQ96N20 296 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 SERPINE3A8MV23 424 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 AGPAT2O15120 278 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 LHX2P50458 406 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 C2orf50Q96LR7 162 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 GPR132Q9UNW8 380 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 NGFP01138 241 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CD74P04233 296 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CALCRP30988 508 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FAM117AQ9C073 453 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ASCL1P50553 236 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 MDP1Q86V88 176 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 VCANP13611 3396 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 DEGS1O15121 323 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 RD3LP0DJH9 198 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 NME2P22392 152 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CD82P27701 267 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 RNF138Q8WVD3 245 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 SCN3AQ9NY46 2000 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 LINC01387J3KSC0 135 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 GLAP06280 429 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN7-201ENST00000296328 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 H7C2Y5 167 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 MFNGO00587 321 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 LRP3O75074 770 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 PET100P0DJ07 73 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 GCH1P30793 250 aa4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
UBXN7-201ENST00000296328 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms