RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 RTL6Q6ICC9 239 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TRAPPC6AO75865 159 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ACRP10323 421 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 RPS2P15880 293 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CD33P20138 364 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 WNT5AP41221 380 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EGR4Q05215 589 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 MGAT2Q10469 447 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TEX38Q6PEX7 206 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SLC26A10Q8NG04 563 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SDSLQ96GA7 329 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OR2A5Q96R48 311 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 MYOTQ9UBF9 498 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 RP1P56715 2156 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0A6YYD4 124 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 HPNP05981 417 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 LYL1P12980 280 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 RRADP55042 308 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF266Q14584 549 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CARD17Q5XLA6 110 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 BRICD5Q6PL45 260 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OOSP2Q86WS3 158 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OR13D1Q8NGV5 346 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SHDQ96IW2 340 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC74BQ96LY2 380 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SEMA5BQ9P283 1151 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF728P0DKX0 622 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 FSTP19883 344 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM50BP56557 158 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB103AP81534 67 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TESK1Q15569 626 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EMC4Q5J8M3 183 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 FAM57BQ71RH2 274 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 MED29Q9NX70 200 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EYSQ5T1H1 3165 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 AQP7O14520 342 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35E2P0CK97 266 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 GP1BBP13224 206 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 HLA-DOBP13765 273 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TDGF1P3P51864 188 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SEC13P55735 322 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PATE1Q8WXA2 126 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 GINS3Q9BRX5 216 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PARD6AQ9NPB6 346 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 V9GYS6 101 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EML5Q05BV3 1969 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0U1RQK1 487 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PR80 420 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CA13Q8N1Q1 262 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 OR10A5Q9H207 317 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 H7BYZ3 331 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 EPHA1P21709 976 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 DUSP1P28562 367 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ICAM4Q14773 271 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 BATF2Q8N1L9 274 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PIGTQ969N2 578 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TBX15Q96SF7 602 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 DIRC2Q96SL1 478 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 FGF22Q9HCT0 170 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1456Q9P272 454 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 HSPB2A8KAH6 182 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 K7N7A8 449 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 CD55P08174 381 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 TLE4Q04727 773 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 HSPB2Q16082 182 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 PCK2Q16822 640 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRR-201ENST00000283228 SLC16A14Q7RTX9 510 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms