RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PRSS12P56730 875 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM196Q5HYL7 178 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR5D13Q8NGL4 314 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 TAAR9Q96RI9 348 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 RASL12Q9NYN1 266 aa16.05■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 A0A1B0GTQ1 180 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR2M5A3KFT3 312 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CCKARP32238 428 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ZFPL1O95159 310 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PTGFRP43088 359 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF83P51522 516 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF154Q13106 437 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR1C1Q15619 314 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR11G2Q8NGC1 345 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ABCA3Q99758 1704 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR2D2Q9H210 308 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CACNG5Q9UF02 275 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 EPPINO95925 133 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 DHRS11Q6UWP2 260 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PRDM7Q9NQW5 492 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PLPP2O43688 288 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 HTR1DP28221 377 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 POM121Q96HA1 1249 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 FAM210BQ96KR6 192 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 GNRHR2Q96P88 292 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CLDN34H7C241 214 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CTGFP29279 349 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SELENOPP49908 381 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CD300CQ08708 224 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 NTNG2Q96CW9 530 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 MPZL1O95297 269 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 MPC2O95563 127 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 GNG3P63215 75 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 FUT7Q11130 342 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 TTC9Q92623 222 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 C17orf47Q8NEP4 570 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SPSB1Q96BD6 273 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 IP6K3Q96PC2 410 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ST8SIA5O15466 376 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CAMPP49913 170 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A1P53007 311 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM56Q96MV1 263 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.03■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 NCMAPQ5T1S8 102 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 FNDC7Q5VTL7 733 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 LRP11Q86VZ4 500 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 NAA60Q9H7X0 242 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR1A1Q9P1Q5 309 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 FBXL17Q9UF56 701 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 WNT3P56703 355 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 OR4C3Q8NH37 302 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 PRSS41Q7RTY9 318 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 MCHR2Q969V1 340 aa16.02■□□□□ 0.16
COL5A3-201ENST00000264828 DHRS3O75911 302 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 RNF224P0DH78 156 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 LINC00052Q96N35 136 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 IER2Q9BTL4 223 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 SLC17A5Q9NRA2 495 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 PRR35P0CG20 571 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 DYNLT3P51808 116 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 OR10G9Q8NGN4 311 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 NPTNQ9Y639 398 aa16.02■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 GLULP15104 373 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 RPL7P18124 248 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 HYAL1Q12794 435 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 GFRALQ6UXV0 394 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 CIDEAO60543 219 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 C4orf45Q96LM5 186 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 IL21Q9HBE4 155 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 CYR61O00622 381 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 PGA3P0DJD8 388 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.01■□□□□ 0.15
COL5A3-201ENST00000264828 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms