RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	HBG1	P69891	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	HBG2	P69892	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PRR22	Q8IZ63	422 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RLF	Q13129	1914 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		H3BNC9	293 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR75	O95800	540 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR4A8	P0C604	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GZMB	P10144	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	IRF2	P14316	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ECI1	P42126	302 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB30	Q15771	203 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	IRF7	Q92985	503 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF205	O95201	554 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RUNX1	Q01196	453 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GKN2	Q86XP6	184 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NRTN	Q99748	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SPINK4	O60575	86 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	WNT5A	P41221	380 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NUDT11	Q96G61	164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1W2PR80	420 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895		K7ESM1	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CIDEA	O60543	219 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CST9	Q5W186	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR4X1	Q8NH49	305 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	EMD	P50402	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	UCP3	P55916	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OTOS	Q8NHW6	89 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PIGT	Q969N2	578 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NAT8	Q9UHE5	227 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	HLA-DOB	P13765	273 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SRPX	P78539	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF774	Q6NX45	483 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	SYT13	Q7L8C5	426 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SPIN3-231	ENST00000639895	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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