RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5M9Q8NGP3 310 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FCGR3BO75015 233 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 NMUP48645 174 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FABP5Q01469 135 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM215Q68D42 235 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO17Q96EF6 278 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 M0QZK8 103 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 GGCTO75223 188 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLCO2B1O94956 709 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAT1Q6PIZ9 186 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 STAC2Q6ZMT1 411 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5C1Q8NGR4 320 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PRRX1P54821 245 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OTPQ5XKR4 325 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CDAP32320 146 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CLDN18P56856 261 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SHBQ15464 509 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 VWA2Q5GFL6 755 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A20A6NK97 555 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PLPP1O14494 284 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 HIST3H3Q16695 136 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DYNLRB2Q8TF09 96 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PFN3P60673 137 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 MUC15Q8N387 334 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF426Q9BUY5 554 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ANXA10Q9UJ72 324 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 K7EQS6 105 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 VAMP5O95183 116 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 KIR2DS2P43631 304 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC38A11Q08AI6 406 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CLEC1BQ9P126 229 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FREM3P0C091 2139 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALT1P15291 398 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 LIMK1P53667 647 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC37A1P57057 533 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RIGQ13278 110 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 REC114Q7Z4M0 266 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 HDAC8Q9BY41 377 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 KLK11Q9UBX7 282 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 MICBQ29980 383 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 COA4Q9NYJ1 87 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TCF21O43680 179 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CSNK1DP48730 415 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SDF2Q99470 211 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FZD2Q14332 565 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SAXO2Q658L1 398 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDT10Q8NFP7 164 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDT11Q96G61 164 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC00052Q96N35 136 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 SELENBP1Q13228 472 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX37Q96LM6 180 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM218A2RU14 115 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 A6NJY4 79 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CORTO00230 105 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM229BQ8NBD8 167 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 FAHP16930 419 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 EVX1P49640 407 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 RELBQ01201 579 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 TWIST1Q15672 202 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 HFEQ30201 348 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 GMLQ99445 158 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 LMX1BO60663 402 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-207ENST00000613246 ISL2Q96A47 359 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms