RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C1orf21Q9H246 121 aa9□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PIGLQ9Y2B2 252 aa9□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PLXNB1O43157 2135 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 G3V4G9 280 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GSC2O15499 205 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CHST1O43916 411 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF254O75437 659 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DHRS3O75911 302 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NRASP01111 189 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PGA5P0DJD9 388 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCL3L1P16619 93 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRDX2P32119 198 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HAAOP46952 286 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BMXP51813 675 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF273Q14593 569 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SNAPC1Q16533 368 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM42Q69YG0 159 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q6ZTK2 550 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF561Q8N587 486 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.99□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1B0GTI1 187 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 J3QT63 122 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PRKYO43930 277 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FKBP6O75344 327 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OPN1MWP04001 364 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 COX7A1P24310 79 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRISP1P54107 249 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CBX1P83916 185 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C11orf88Q6PI97 169 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 BATF2Q8N1L9 274 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2T27Q8NH04 317 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 APOL4Q9BPW4 351 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HES4Q9HCC6 221 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GPR173Q9NS66 373 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 USE1Q9NZ43 259 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 V9GYS6 101 aa8.98□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A1W2PPH5 198 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 M0R129 80 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC1A7O00341 560 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DLGAP1O14490 977 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM107AO95990 144 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TK1P04183 234 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MPZP25189 248 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DAPP51397 102 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DLX6P56179 175 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CXCR4P61073 352 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ERVK11-1P61568 191 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAHD1Q6P587 224 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q6ZSR3 168 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPATA24Q86W54 205 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF573Q86YE8 665 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CALHM1Q8IU99 346 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TEX12Q9BXU0 123 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms