RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 DRAM2Q6UX65 266 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CD177Q8N6Q3 437 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SPSB4Q96A44 273 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 REEP6Q96HR9 211 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NSL1Q96IY1 281 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PRRC1Q96M27 445 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MICU1Q9BPX6 476 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 COPS4Q9BT78 406 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 C1orf21Q9H246 121 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SP140LQ9H930 580 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ABCD2Q9UBJ2 740 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 B9D1Q9UPM9 204 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.51□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 TMEM210A6NLX4 147 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 FFAR1O14842 300 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DIRAS1O95057 198 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NDUFB2O95178 105 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 FAM107AO95990 144 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PSKH1P11801 424 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GP9P14770 177 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SPNP16150 400 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ZNF823P16415 610 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DCTDP32321 178 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ACTA2P62736 377 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ACTG2P63267 376 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ACTC1P68032 377 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ACTA1P68133 377 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PRDX4Q13162 271 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 IL18R1Q13478 541 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 TIGD6Q17RP2 521 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 KLHL12Q53G59 568 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 LCN8Q6JVE9 175 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CALHM1Q8IU99 346 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PGAM4Q8N0Y7 254 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 LINC00471Q8N535 108 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 STMN2Q93045 179 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MCUR1Q96AQ8 359 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PYURFQ96I23 114 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NSMCE2Q96MF7 247 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SPATA25Q9BR10 227 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 FN3KQ9H479 309 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GORASP2Q9H8Y8 452 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NDE1Q9NXR1 346 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CD300AQ9UGN4 299 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 HERC1Q15751 4861 aa5.5□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 A0A087WUU8 490 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SERPINE3A8MV23 424 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 M0QZK8 103 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SLC1A7O00341 560 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ARPC2O15144 300 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 PTP4A3O75365 173 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 TXNDC12O95881 172 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 RBP4P02753 201 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 ZNF728P0DKX0 622 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 HSD17B1P14061 328 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 RHCEP18577 417 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 HTR1DP28221 377 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 NOS3P29474 1203 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 BRS3P32247 399 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GSK3AP49840 483 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 INSL3P51460 131 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 GPM6AP51674 278 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SMIM11AP58511 58 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 FXYD6P3P58550 94 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 SLC35B1P78383 322 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 FHL3Q13643 280 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 KIR2DS1Q14954 304 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.49□□□□□ -1.53
CTC1-211ENST00000583254 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms