RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	LGALS4	P56470	323 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZS46	218 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT77	Q7Z794	578 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF561	Q8N587	486 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5M11	Q96RB7	305 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	USE1	Q9NZ43	259 aa		10.15	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PPH5	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		A6NDX4	124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC1A7	O00341	560 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PRODH	O43272	600 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PGA5	P0DJD9	388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC2A5	P22732	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	GINS1	Q14691	196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	LCN8	Q6JVE9	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	COMMD2	Q86X83	199 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TEAD3	Q99594	435 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.14	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PPE2	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PR64	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PRV1	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		J3QT63	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TK1	P04183	234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ARG1	P05089	322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	HAAO	P46952	286 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	MS4A2	Q01362	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	SSX2	Q16385	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	NDE1	Q9NXR1	346 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ACOD1	A6NK06	481 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	NXPH2	O95156	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	NRAS	P01111	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP6V1B1	P15313	513 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLL1	P15814	213 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	BLCAP	P62952	87 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK5	Q00535	292 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	DHFR2	Q86XF0	187 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR173	Q9NS66	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	COPS3	Q9UNS2	423 aa		10.12	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PRX2	142 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		K7EIL1	84 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931		K7N7A8	449 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	GSC2	O15499	205 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PEX14	O75381	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
LETMD1-231	ENST00000551931	DHRS3	O75911	302 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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