RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CSNK1G2P78368 415 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TCTN1Q2MV58 587 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA45Q537H7 98 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CALHM1Q8IU99 346 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SPSB2Q99619 263 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PDFQ9HBH1 243 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WUU8 490 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GV50 99 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A1L4Q6 167 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SERINC4A6NH21 518 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf80F5H4A9 247 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ETHE1O95571 254 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PMS2P2O95744 297 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-GP17693 338 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CR2P20023 1033 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 UCP1P25874 307 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM64Q6YI46 380 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PTOV1Q86YD1 416 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SEH1LQ96EE3 360 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 VAX2Q9UIW0 290 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PSG11Q9UQ72 335 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MYH11P35749 1972 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf72A6NCS6 295 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MCRIP1C9JLW8 97 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 K7EQS6 105 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GPR39O43194 453 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT3O60512 393 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LCATP04180 440 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CD37P11049 281 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB6P28072 239 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PIGAP37287 484 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX1P51575 399 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MTPNP58546 118 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R20P59543 309 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 OR7A5Q15622 319 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 XKR7Q5GH72 579 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 OR5B3Q8NH48 314 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM239Q8WW34 195 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 COPS9Q8WXC6 57 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 LHX9Q9NQ69 397 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 HSF4Q9ULV5 492 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TCHHQ07283 1943 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 UBL3O95164 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 NNATQ16517 81 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF385BQ569K4 471 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ISCA2Q86U28 154 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RNF175Q8N4F7 328 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRB-210ENST00000551525 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 VDAC3Q9Y277 283 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PR80 420 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf170A2RU37 121 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 HPRT1P00492 218 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 CD22P20273 847 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 ACHEP22303 614 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 SIRPAP78324 504 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 PCLAFQ15004 111 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 RPEL1Q2QD12 228 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TP53I3Q53FA7 332 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZRG5 221 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.64□□□□□ -1.51
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