RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4K15Q8NH41 348 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC107Q8WV48 283 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGCQ92535 297 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 BORCS8Q96FH0 119 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 POM121Q96HA1 1249 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 BOD1Q96IK1 185 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR137Q96N19 417 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A13Q99584 98 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 POFUT1Q9H488 388 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf49Q9H741 205 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IFT46Q9NQC8 304 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF69Q9UC07 566 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HSF4Q9ULV5 492 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 VSIG4Q9Y279 399 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2QL1A1L167 161 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf49A4QMS7 147 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINE3A8MV23 424 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPTL7O43827 346 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HTR3BO95264 441 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 NGFP01138 241 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IL2RAP01589 272 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4E1P0C645 316 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CCL2P13500 99 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB25P24278 435 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 DNASE1P24855 282 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HRH1P35367 487 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RAP2BP61225 183 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 DHODHQ02127 395 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PLP2Q04941 152 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MPPED2Q15777 294 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TBR1Q16650 682 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MICBQ29980 383 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RTL6Q6ICC9 239 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CD163Q86VB7 1156 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 WNT2BQ93097 391 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SARAFQ96BY9 339 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RADILQ96JH8 1075 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TAAR6Q96RI8 345 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2AT4A6NND4 320 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MSTNO14793 375 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNHIT1O43257 154 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PMP2P02689 132 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV1-2P23083 117 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 WNT5AP41221 380 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MALLQ13021 153 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ARFRP1Q13795 201 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RSU1Q15404 277 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA5Q16718 116 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZS92 163 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MDP1Q86V88 176 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FAHD2AQ96GK7 314 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OPA3Q9H6K4 179 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms