RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MFRPQ9BY79 579 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EXO5Q9H790 373 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM129A0AVI4 362 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 K7ENP7 123 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GCGP01275 180 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DPB1P04440 258 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RLN1P04808 185 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G5P39877 138 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CAV2P51636 162 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GFRA1P56159 465 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TLE3Q04726 772 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB40BQ12829 278 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB35Q15286 201 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PXKQ7Z7A4 578 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CPOQ8IVL8 374 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF519Q8TB69 540 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD1Q96SE0 405 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 INTS14Q96SY0 518 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TXN2Q99757 166 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HES7Q9BYE0 225 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10A4Q9H209 315 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RASD1Q9Y272 281 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf202A1L168 122 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF222A6NCQ9 220 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CBY3A6NI87 242 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP7P3A6NL99 342 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NNC1 897 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MS4A18H0YCH9 400 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC6AO75865 159 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NCR1O76036 304 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 VAMP5O95183 116 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A10O95528 541 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A4P12235 298 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A5P22732 501 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SFTPDP35247 375 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MTNR1AP48039 350 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 CRMP1Q14194 572 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DRAM2Q6UX65 266 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF546Q86UE3 836 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 Q96M85 177 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DIRC2Q96SL1 478 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 MSL2Q9HCI7 577 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ASB6Q9NWX5 421 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PNR3 127 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 J3KRW8 73 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QW42 95 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 DFFBO76075 338 aa6.36□□□□□ -1.39
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