RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462229.1

PHF19-208, Transcript of PHD finger protein 19, human

TSL 2

Gene PHF19, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF19-208	ENST00000462229	MUL1	Q969V5	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PHF19-208	ENST00000462229	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PHF19-208	ENST00000462229	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PHF19-208	ENST00000462229	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PHF19-208	ENST00000462229	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PHF19-208	ENST00000462229	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ISPD	A4D126	451 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	WNT9B	O14905	357 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	AKR7A2	O43488	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SYNGR1	O43759	233 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF205	O95201	554 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	UCHL1	P09936	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	PGA5	P0DJD9	388 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CD99	P14209	185 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	FOSL1	P15407	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	EGR1	P18146	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CPT2	P23786	658 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	FABP5	Q01469	135 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	KISS1	Q15726	138 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MKX	Q8IYA7	352 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	POC1A	Q8NBT0	407 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	AKAP9	Q99996	3911 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	GABRP	O00591	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	NDUFA2	O43678	99 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CYB5A	P00167	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	HEXA	P06865	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SRM	P19623	302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	GLRA1	P23415	457 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CD80	P33681	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	LMO4	P61968	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MICB	Q29980	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	GAL3ST1	Q99999	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	PLAT	P00750	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	POU3F4	P49335	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ZP1	P60852	638 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229		Q8IYB0	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	OR51F2	Q8NH61	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	RFT1	Q96AA3	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	RAB39B	Q96DA2	213 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	CEP19	Q96LK0	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	GPER1	Q99527	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PHF19-208	ENST00000462229	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms