RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVFC1-1P60608 527 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB35Q15286 201 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 PHF19Q5T6S3 580 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM156Q8N614 296 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 TP53I11O14683 189 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC3AO75596 197 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 COX18Q8N8Q8 333 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 HDAC8Q9BY41 377 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 MYOTQ9UBF9 498 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 MEMO1Q9Y316 297 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL12A8MUP2 240 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 GCGP01275 180 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC11BP0C7V7 166 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 ALOX5APP20292 161 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRA1P23415 457 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 EMDP50402 254 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 RND3P61587 244 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 YPEL5P62699 121 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 LFNGQ8NES3 379 aa7.41□□□□□ -1.22
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