RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM156Q8N614 296 aa15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SYT3Q9BQG1 590 aa15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 WFDC1Q9HC57 220 aa15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PPE2 198 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FOXF1Q12946 379 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 Q96M66 194 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 KIAA1456Q9P272 454 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.94■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF728P0DKX0 622 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR5H8P0DN80 308 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 GFERP55789 205 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PIGPP57054 158 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR2B8PP59922 312 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RNF4P78317 190 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 TFF2Q03403 129 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ABCA11PQ4W5N1 156 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FAM57BQ71RH2 274 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PGAM5Q96HS1 289 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 STMND1H3BQB6 276 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SCGB1D2O95969 90 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ARG1P05089 322 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SFTPDP35247 375 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FBXO17Q96EF6 278 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OXGR1Q96P68 337 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RSRP1Q9BUV0 290 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 EMC6Q9BV81 110 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PITX3O75364 302 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 CDS2O95674 445 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SERPINA2P20848 420 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 EFNA3P52797 238 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MYBPHQ13203 477 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 GNMTQ14749 295 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR10G4Q8NGN3 311 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SPSB1Q96BD6 273 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 B4DEV8 164 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 DAOP14920 347 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MYOGP15173 224 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 TGIF1Q15583 401 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FBXW12Q6X9E4 464 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 POM121Q96HA1 1249 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SOX7Q9BT81 388 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PPC4 97 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 HSPA12AO43301 675 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 IFNA10P01566 189 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 CA3P07451 260 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FOSL1P15407 271 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 DEFA6Q01524 100 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR8B8Q15620 311 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 LCN10Q6JVE6 187 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 C1QL2Q7Z5L3 287 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MR1Q95460 341 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 BOD1Q96IK1 185 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 PFDN5Q99471 154 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1B0GX78 115 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 RER1O15258 196 aa15.9■□□□□ 0.14
KRCC1-201ENST00000347055 OR5AC1P0C628 307 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms