RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.79□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 OR5H15A6NDH6 313 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LMX1BO60663 402 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 UNC119Q13432 240 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 HLA-BQ31612 363 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ESX1Q8N693 406 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 KIRREL1Q96J84 757 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 G3V3Y1 287 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 HPNP05981 417 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 STARD6P59095 220 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 FAM27BQ5VT28 67 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ZNF175Q9Y473 711 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 TRIM77I1YAP6 450 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 PDCD6O75340 191 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 GLAP06280 429 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 CD80P33681 288 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ3P48549 501 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SRYQ05066 204 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 TM2D1Q9BX74 207 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 REG4Q9BYZ8 158 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 CDH20Q9HBT6 801 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 HSF4Q9ULV5 492 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 MFNGO00587 321 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ADAP1O75689 374 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 AKR1C2P52895 323 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 AKR1C1Q04828 323 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A45Q8N413 288 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 NPAS1Q99742 590 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LHX6Q9UPM6 363 aa7.78□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ABCD4O14678 606 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CXCL13O43927 109 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 S100A8P05109 93 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CD37P11049 281 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FGF5P12034 268 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LTBRP36941 435 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF529Q6P280 563 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF561Q8N587 486 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF709Q8N972 641 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 V9GYS6 101 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WV48 116 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GPR31O00270 319 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RAC2P15153 192 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DMWDQ09019 674 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FBXL17Q9UF56 701 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RNF150Q9ULK6 438 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SULT1A2P50226 295 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MZT1Q08AG7 82 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LILRB2Q8N423 598 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TCEAL3Q969E4 200 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CRLF2Q9HC73 371 aa7.77□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SEC11BP0C7V7 166 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF44P15621 663 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CTSSP25774 331 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OPRM1P35372 400 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MLF1P58340 268 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HBG1P69891 147 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HBG2P69892 147 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FAM3AP98173 230 aa7.76□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MSMO1Q15800 293 aa7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms