RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA40Q86UY6 237 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF101Q8IZC7 436 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM89BQ8N5H3 189 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SNAPC3Q92966 411 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST5Q9GZS9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HPNP05981 417 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HCKP08631 526 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 NAT2P11245 290 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GNG2P59768 71 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PPA1Q15181 289 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CLVS2Q5SYC1 327 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX261Q6UWH6 196 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CHST4Q8NCG5 386 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10D3Q8NH80 312 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ATPIF1Q9UII2 106 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 U3KQ87 197 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR14I1A6ND48 311 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC14BO60729 498 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A1P11166 492 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 GDF1P27539 372 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A14Q7RTX9 510 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CD163Q86VB7 1156 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 STEAP2Q8NFT2 490 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8S1Q8NH09 359 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LYZL4Q96KX0 146 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM59Q9BXS4 323 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 RGCCQ9H4X1 137 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEK2Q9NYT0 353 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC23A1Q9UHI7 598 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PLSCR5A0PG75 271 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 MEIS3P1A6NDR6 274 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBAL3A6NHL2 446 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C65A6NJZ3 312 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SGCEO43556 437 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCL13O43927 109 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNA7P01567 189 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR2BP41595 481 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 CHMP1BQ7LBR1 199 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT46Q9NQC8 304 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNGR3O43761 229 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.09■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF122Q9H9V4 155 aa22.09■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6C6A6NF89 314 aa22.08■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 F5H5P2 479 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4E1P0C645 316 aa22.08■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN5P62079 268 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 FTMTQ8N4E7 242 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8H1Q8NGG4 311 aa22.08■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TM2D1Q9BX74 207 aa22.08■■□□□ 1.13
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CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 KISS1Q15726 138 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf46Q504U0 113 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF680Q8NEM1 530 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.08■■□□□ 1.12
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