RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.24	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A0B4J2A0	478 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	NKX2-8	O15522	239 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	KLK10	O43240	276 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FUT6	P51993	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	C9orf172	C9J069	976 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PMP22	Q01453	160 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	LYG2	Q86SG7	212 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	CELA3A	P09093	270 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	CST2	P09228	141 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	TBP	P20226	339 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	LYZL6	O75951	148 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	GABRA1	P14867	456 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	RGCC	Q9H4X1	137 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.23	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A1B0GV50	99 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SERPINE2	P07093	398 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PSG4	Q00888	419 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	GFI1	Q99684	422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	GSK3A	P49840	483 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	BPTF	Q12830	3046 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A0D9SG52	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FCGR2C	P31995	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	LIMK1	P53667	647 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.22	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	RGS11	O94810	467 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF205	O95201	554 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FABP6	P51161	128 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PTGDS	P41222	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NFE2L1-222	ENST00000585291	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	HAS2	Q92819	552 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAB27B	O00194	218 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	FBXO24	O75426	580 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.21	□□□□□ -0.62

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