RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570385.1

CTDNEP1-203, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-203ENST00000570385 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 LCN8Q6JVE9 175 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 MKXQ8IYA7 352 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.01□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.01□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 OR51I2Q9H344 312 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF222Q9UK12 451 aa7.01□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 LRP12Q9Y561 859 aa7.01□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 THAP5Q7Z6K1 395 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 CD177Q8N6Q3 437 aa7□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 OR4C13Q8NGP0 309 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZNF671Q8TAW3 534 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR51E1Q8TCB6 317 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 AQP3Q92482 292 aa7□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 SYNGR1O43759 233 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 E2F6O75461 281 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 HMGN1P05114 100 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 PRDX2P32119 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 KIR2DS4P43632 304 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 MNAT1P51948 309 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-203ENST00000570385 COPS3Q9UNS2 423 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR5B21A6NL26 309 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRODHO43272 600 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-203ENST00000570385 INMTO95050 263 aa6.98□□□□□ -1.29
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