RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		M0R143	59 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	MASP2	O00187	686 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	HSD17B6	O14756	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	AGPAT2	O15120	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	NME2P1	O60361	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	OR6A2	O95222	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	PNP	P00491	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	PRH1	P02810	166 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	BGLAP	P02818	100 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TK1	P04183	234 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ARG1	P05089	322 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	APOD	P05090	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	CSN2	P05814	226 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	C8A	P07357	584 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SFTPB	P07988	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SOD3	P08294	240 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	LIPC	P11150	499 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	NDUFB7	P17568	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	AMY2B	P19961	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DTYMK	P23919	212 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	UCP1	P25874	307 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DUSP1	P28562	367 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	IL2RG	P31785	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SFTPD	P35247	375 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	P2RY2	P41231	377 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	GPR3	P46089	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	OR3A2	P47893	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TNFSF10	P50591	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	EMP2	P54851	167 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	UCP3	P55916	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	UBE2K	P61086	200 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TLE4	Q04727	773 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	EGR4	Q05215	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FUT7	Q11130	342 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ZP4	Q12836	540 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	RAB35	Q15286	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TAF9	Q16594	264 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	BMF	Q96LC9	184 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	GPR84	Q9NQS5	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	BRCA2	P51587	3418 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		A0A087WZY1	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		A0A1B0GTH9	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		A0A1W2PQY0	241 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151		H3BS24	57 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BBS4-216	ENST00000569151	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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