RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.48□□□□□ -1.37
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SEC31A-241ENST00000515749 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.372e-8■■■■□ 21.3
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SEC31A-241ENST00000515749 SMPD2O60906 423 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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SEC31A-241ENST00000515749 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.46□□□□□ -1.38
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SEC31A-241ENST00000515749 TBPP20226 339 aa6.46□□□□□ -1.38
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SEC31A-241ENST00000515749 RCVRNP35243 200 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 PMELP40967 661 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 WNT5AP41221 380 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 VEGFCP49767 419 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 TAS2R19P59542 299 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 PPP1CBP62140 327 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 PLA2G7Q13093 441 aa6.46□□□□□ -1.38
SEC31A-241ENST00000515749 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.46□□□□□ -1.38
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