RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ST8SIA4Q92187 359 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CYYR1Q96J86 154 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF75AQ96N20 296 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A7Q96R45 310 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CHST6Q9GZX3 395 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GLRX2Q9NS18 164 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF222Q9UK12 451 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 DISC1C4P0D8 188 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V1G1O75348 118 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 NRASP01111 189 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF24P17028 368 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CBX5P45973 191 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FUT6P51993 359 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MTCP1P56278 107 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB1AP62820 205 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PPA1Q15181 289 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PXT1Q8NFP0 134 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SNAPC3Q92966 411 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 Q96M66 194 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TECTBQ96PL2 329 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PECRQ9BY49 303 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IL36GQ9NZH8 169 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 AKR7A2O43488 359 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CST4P01036 141 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV1D-12P01611 117 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RLN1P04808 185 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA5P05154 406 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CD79AP11912 226 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CPT2P23786 658 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RBP2P50120 134 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP1B3P54709 279 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG2P59768 71 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL6IP1Q15041 203 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52W1Q6IF63 320 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MOB3CQ70IA8 216 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 HOGA1Q86XE5 327 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8NFD4 153 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXW5Q969U6 566 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PRRT1Q99946 306 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 GON7Q9BXV9 100 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL9Q9H1A3 318 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CA10Q9NS85 328 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 STARD10Q9Y365 291 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 RTTNQ86VV8 2226 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM82A0PJX8 343 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BUI4 141 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM225BP0DP42 221 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 SERPINA2P20848 420 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS12P56730 875 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTBL2Q562R1 376 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms