RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.32□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.31□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 A6NLC8 198 aa7.31□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.3□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 A6NIN4 97 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF732B4DXR9 585 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 E9PI62 339 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 FOXH1O75593 365 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 RHBDL1O75783 438 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 HTR1AP08908 422 aa7.29□□□□□ -1.24
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