RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 WIPF3A6NGB9 483 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 J3QLW9 94 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TXNDC12O95881 172 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CT45A8P0DMV1 189 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CT45A9P0DMV2 189 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PGAM2P15259 253 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF19P17023 458 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MAOAP21397 527 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR12D2P58182 307 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF85Q03923 595 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ODF1Q14990 250 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TEX38Q6PEX7 206 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CDHR4A6H8M9 788 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MASP2O00187 686 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PPP1R2P9O14990 202 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF208O43345 1280 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NDUFB8O95169 186 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ARG1P05089 322 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CD1AP06126 327 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SRMP19623 302 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CD34P28906 385 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR3A1P47881 315 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TNFSF10P50591 281 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR2A2Q6IF42 318 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR2T33Q8NG76 320 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SMIM19Q96E16 107 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SYT3Q9BQG1 590 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RGCCQ9H4X1 137 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ABI3Q9P2A4 366 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ETV7Q9Y603 341 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SPACA6W5XKT8 324 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ATMQ13315 3056 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CDC14CA4D256 554 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 XRCC3O43542 346 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NTN1O95631 604 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 EPPINO95925 133 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FGF7P21781 194 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LPAR6P43657 344 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NUDT11Q96G61 164 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SEC22AQ96IW7 307 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR14A2Q96R54 314 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MYOTQ9UBF9 498 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPE2 198 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 M0R036 132 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HMGN4O00479 90 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SPARCP09486 303 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR4A8P0C604 315 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TBPP20226 339 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HTR2CP28335 458 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PYCR1P32322 319 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF84P51523 738 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TAS2R50P59544 299 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RAC3P60763 192 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DHRS2Q13268 280 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SYPL1Q16563 259 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CD163Q86VB7 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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