RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 MLF1P58340 268 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 DRAM2Q6UX65 266 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 BAP18Q8IXM2 172 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 TAF9Q16594 264 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 P04436 131 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 OTX2P32243 289 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 PTGER4P35408 488 aa14.77□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 ARL6IP1Q15041 203 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 POC1AQ8NBT0 407 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.77□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 C10orf35Q96D05 121 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-207ENST00000462494 Q96M66 194 aa14.77□□□□□ -0.04
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ACTB-207ENST00000462494 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
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ACTB-207ENST00000462494 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 SULF2Q8IWU5 870 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 ARID1AO14497 2285 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 FAM74A7A6NL05 159 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 SYNGR3O43761 229 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CXCL13O43927 109 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 PET100P0DJ07 73 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 CRYGSP22914 178 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 NAAAQ02083 359 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-207ENST00000462494 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
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