RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 GAFA1Q96PS6 74 aa19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 GABRB1P18505 474 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP5-208ENST00000459627 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBTB37Q5TC79 503 aa19.77■□□□□ 0.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP5-208ENST00000459627 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP5-208ENST00000459627 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP5-208ENST00000459627 DBTP11182 482 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 PSG2P11465 335 aa19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2V2Q15819 145 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 LPCAT4Q643R3 524 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2G2Q8NGZ5 317 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF671Q8TAW3 534 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 LHX4Q969G2 390 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ADI1Q9BV57 179 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHA1Q9HB21 404 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD61A6NGH8 418 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFB7P17568 137 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ACTC1P68032 377 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 ACTA1P68133 377 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB112Q30KQ8 113 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL11BQ5VVY1 283 aa19.72■□□□□ 0.75
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