RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 FAM57BQ71RH2 274 aa14.67□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.67□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 NXPH3O95157 252 aa14.66□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 DANCRP0C864 163 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 CTSEP14091 401 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 FAM3AP98173 230 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 IL15RAQ13261 267 aa14.66□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 SLC39A7Q92504 469 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 CHST5Q9GZS9 411 aa14.66□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 MMP16P51512 607 aa14.65□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 Q8WTZ3 238 aa14.65□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 OR5AS1Q8N127 324 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.65□□□□□ -0.06
PKP4-204ENST00000421462 PIGTQ969N2 578 aa14.65□□□□□ -0.06
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PKP4-204ENST00000421462 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.64□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.64□□□□□ -0.07
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PKP4-204ENST00000421462 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.64□□□□□ -0.07
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PKP4-204ENST00000421462 POM121Q96HA1 1249 aa14.64□□□□□ -0.07
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PKP4-204ENST00000421462 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 TAS2R46P59540 309 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 KHDC3LQ587J8 217 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 TOX2Q96NM4 488 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP4-204ENST00000421462 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.63□□□□□ -0.07
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