RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYNP07948 512 aa10.68□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.68□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4F4Q96R69 305 aa10.66□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPAL2Q9H841 368 aa10.66□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPE2 198 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PR64 198 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PRV1 198 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5B21A6NL26 309 aa10.65□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VGLL3A8MV65 326 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BN98 237 aa10.65□□□□□ -0.7
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM21Q3B7S5 101 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATS1Q496A3 300 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf89Q6UX73 402 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF561Q8N587 486 aa10.65□□□□□ -0.7
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.65□□□□□ -0.7
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