RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FITM1A5D6W6 292 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 H0YIZ8 118 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 OR2C1O95371 312 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DBHP09172 617 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CT62P0C5K7 136 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DANCRP0C864 163 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CBR1P16152 277 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA3P26006 1051 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CAMLGP49069 296 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PKIAP61925 76 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ID2Q02363 134 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HGFACQ04756 655 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 IL15RAQ13261 267 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ODF4Q2M2E3 257 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ACER2Q5QJU3 275 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A25Q6T423 547 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD6Q86Y78 171 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 BCORP1Q8N888 145 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf44Q96CB5 159 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD6Q9BV23 337 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CHST5Q9GZS9 411 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ARV1Q9H2C2 271 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LRP12Q9Y561 859 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.34□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0J9YY10 115 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GTH9 108 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A6NLC8 198 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 B4DEV8 164 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 H0YGG7 62 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R2P9O14990 202 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DEDDO75618 318 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1D-16P01601 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LIPCP11150 499 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 EMP2P54851 167 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN6P56747 220 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 S100A10P60903 97 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35A1P78382 337 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF117Q03924 483 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SPOCK1Q08629 439 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SKP2Q13309 424 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RAB32Q13637 225 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CARFQ8N187 725 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10G6Q8NH81 332 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 LOXL4Q96JB6 756 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PRRX2Q99811 253 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RAB33BQ9H082 229 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPH5 198 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MSGN1A6NI15 193 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 B9A039 149 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DCTN6O00399 190 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms