RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD2Q86X83 199 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC29Q8WV35 223 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2FQ969M7 185 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 UPRTQ96BW1 309 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf35Q96D05 121 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS12Q96DT0 336 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 LYZL4Q96KX0 146 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MICU1Q9BPX6 476 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 NEK6Q9HC98 313 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FAM206AQ9NX38 181 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SCN3BQ9NY72 215 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF69Q9UC07 566 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GNG8Q9UK08 70 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 RAB26Q9ULW5 256 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.37□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GVI7 797 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM210A6NLX4 147 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PRR32B1ATL7 298 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CDIPTO14735 213 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS2O15393 492 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PLATP00750 562 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CCR9P51686 369 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 CDONQ4KMG0 1287 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC58Q4VC31 144 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 STX19Q8N4C7 294 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 ST8SIA4Q92187 359 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 MYDGFQ969H8 173 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM80Q96HE8 168 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TBX5Q99593 518 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.36□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.36□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM212A6NML5 194 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SRRM5B3KS81 715 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DVL1O14640 695 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SYT7O43581 403 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FCN3O75636 299 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS3O75911 302 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 APOL3O95236 402 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA3P01011 423 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SFTPBP07988 381 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 HTR1AP08908 422 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FAHP16930 419 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MYF6P23409 242 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CFHR2P36980 270 aa6.35□□□□□ -1.39
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