RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.83□□□□□ -0.03
GDE1-201ENST00000353258 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.83□□□□□ -0.03
GDE1-201ENST00000353258 PRODH2Q9UF12 536 aa14.83□□□□□ -0.03
GDE1-201ENST00000353258 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 PHOX2AO14813 284 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SOCS1O15524 211 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 RAD51DO75771 328 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SCGNO76038 276 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 AMY2BP19961 511 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 PTGER4P35408 488 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 GFERP55789 205 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 UBE2KP61086 200 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 RNF4P78317 190 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 RNF144BQ7Z419 303 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SPACA5Q96QH8 159 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.83□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 H0YL77 283 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 GUSBP08236 651 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CT45A8P0DMV1 189 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CT45A9P0DMV2 189 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HSD11B1P28845 292 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 METTL12A8MUP2 240 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CLDN4O14493 209 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 MPIG6BO95866 241 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ISG15P05161 165 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 TRGC1P0CF51 173 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CXCR1P25024 350 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ACKR1Q16570 336 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LRRC18Q8N456 261 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LMX1AQ8TE12 382 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PPC4 97 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ADAM10O14672 748 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR3A2P47893 321 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 M1APQ8TC57 530 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 GINS3Q9BRX5 216 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SMCO3A2RU48 225 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 A8MWP6 167 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CCR5P51681 352 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HAGHQ16775 308 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 FRZBQ92765 325 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR10A5Q9H207 317 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 SYT7O43581 403 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 P2RY1P47900 373 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 DLK1P80370 383 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 C4orf17Q53FE4 359 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LFNGQ8NES3 379 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 OR5R1Q8NH85 324 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 ATG101Q9BSB4 218 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 BANF2Q9H503 90 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 EHFQ9NZC4 300 aa14.81□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 IFI6P09912 130 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 G0S2P27469 103 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 GPR3P46089 330 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 BLKP51451 505 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 CCL20P78556 96 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.8□□□□□ -0.04
GDE1-201ENST00000353258 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms