RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa9.48□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 CSN3P07498 182 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 OR5AL1P0C617 328 aa9.48□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 PTHLHP12272 177 aa9.48□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 AKR7A2O43488 359 aa9.48□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 DTD1Q8TEA8 209 aa9.48□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 EGR3Q06889 387 aa9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 TMEM215Q68D42 235 aa9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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CLN8-201ENST00000331222 LYSMD2Q8IV50 215 aa9.47□□□□□ -0.89
CLN8-201ENST00000331222 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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