RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNG2Q9Y698 323 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-201ENST00000319942 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MXE2 369 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C417 338 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB27BO00194 218 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC14BO60729 498 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RAC2P15153 192 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 BMP5P22003 454 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 VEGFCP49767 419 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1CBP62140 327 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TSC22D1Q15714 1073 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CDNFQ49AH0 187 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MTFR2Q6P444 385 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX8Q7RTT4 187 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NAXEQ8NCW5 288 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM63Q969Q1 353 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GAL3ST1Q99999 423 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNK15Q9H427 330 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK11Q9UBX7 282 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF3C1Q12789 2109 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 AGFG2O95081 481 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5AP00167 134 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 LPLP06858 475 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CSF1P09603 554 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2F2P13984 249 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A1P30531 599 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RCVRNP35243 200 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTBP60709 375 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTG1P63261 375 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDX4Q13162 271 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC119Q13432 240 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MSMPQ1L6U9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ASCL4Q6XD76 172 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ACBD4Q8NC06 268 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PXT1Q8NFP0 134 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RND1Q92730 232 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CMBLQ96DG6 245 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3CQ96E17 227 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 POM121Q96HA1 1249 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NLKQ9UBE8 527 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TINAGQ9UJW2 476 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MED12LQ86YW9 2145 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MEIOCA2RUB1 952 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf97H3BN30 126 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BUI4 141 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SMPD2O60906 423 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV1-44P01699 117 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MELTFP08582 738 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CELA3BP08861 270 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF35P13682 527 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SPNP16150 400 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MGMTP16455 207 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CPT2P23786 658 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR2DL3P43628 341 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZP1P60852 638 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZTK2 550 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF144BQ7Z419 303 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF573Q86YE8 665 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MKXQ8IYA7 352 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM104Q8NE00 496 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms