RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT27Q9BW83 186 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GON7Q9BXV9 100 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GID8Q9NWU2 228 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 VNN3Q9NY84 501 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ADA2Q9NZK5 511 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CD300AQ9UGN4 299 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 COL7A1Q02388 2944 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C68A6NDL8 312 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ODF3BA8MYP8 253 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTN6O00399 190 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTA4O15217 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A2O15244 555 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2F2O95006 317 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF682O95780 498 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CST4P01036 141 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SPARCP09486 303 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A1P11166 492 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR1DP28221 377 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FMO3P31513 532 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM3P40198 252 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MNDAP41218 407 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CX3CR1P49238 355 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBA2P53672 197 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM11AP58511 58 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 VSNL1P62760 191 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDX4Q13162 271 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MAPRE2Q15555 327 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR86Q86TI4 376 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF695Q8IW36 515 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N3U1 123 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8U1Q8NH10 309 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K13Q8NH42 304 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGCQ92535 297 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PGAM5Q96HS1 289 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CITED4Q96RK1 184 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR25Q96S07 402 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GLS2Q9UI32 602 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.28□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PRQ8 180 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 hADV38S2A0JD32 116 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5B21A6NL26 309 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf98A8MV24 154 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 J3KTA2 159 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA1P01009 418 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF728P0DKX0 622 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL3L1P16619 93 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDX2P32119 198 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ENTPD1P49961 510 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GZMMP51124 257 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DGCR6Q14129 220 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAPC1Q16533 368 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 COQ5Q5HYK3 327 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52W1Q6IF63 320 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR93Q6P2C0 686 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZS46 218 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF596Q8TC21 504 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 STON2Q8WXE9 905 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SGK3Q96BR1 496 aa6.27□□□□□ -1.41
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