RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SPTSSAQ969W0 71 aa24.51■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 M0R135 149 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PJVKQ0ZLH3 352 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DMRTC1Q5HYR2 192 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OR51F2Q8NH61 342 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MAFIPQ8WZ33 124 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF799Q96GE5 643 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 F8W036 122 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 CD63P08962 238 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 RBMXP38159 391 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 BLOC1S1P78537 153 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OR9K2Q8NGE7 335 aa24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 NDUFA2O43678 99 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 GUCA2BQ16661 112 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MST1LQ2TV78 715 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ESX1Q8N693 406 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OR4A4PQ8NGN8 299 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SMIM8Q96KF7 97 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 EDARQ9UNE0 448 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DHRS7CA6NNS2 312 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 HOXB5P09067 269 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PTGER4P35408 488 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 LDLRAD3Q86YD5 345 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SPAG16Q8N0X2 631 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 LRRC18Q8N456 261 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PIGQQ9BRB3 760 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SEC11CQ9BY50 192 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 GSKIPQ9P0R6 139 aa24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 EML6Q6ZMW3 1958 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 KNG1P01042 644 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 FGF5P12034 268 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 LIFP15018 202 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 S100A10P60903 97 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PIGTQ969N2 578 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 Q96M66 194 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DECR2Q9NUI1 292 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 HPF1Q9NWY4 346 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa24.48■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SERPINA5P05154 406 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 EXT1Q16394 746 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 RAET1LQ5VY80 246 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SULF2Q8IWU5 870 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SGPP2Q8IWX5 399 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OR10Z1Q8NGY1 313 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SPSB1Q96BD6 273 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PLEK2Q9NYT0 353 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 VCANP13611 3396 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PI4KAP42356 2102 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 LAMTOR5O43504 91 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SNAPINO95295 136 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 C6orf201Q7Z4U5 140 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 TREM1Q9NP99 234 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OR2S2Q9NQN1 319 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 UQCC1Q9NVA1 299 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.47■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 H7C2Y5 167 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 YKT6O15498 198 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SFTPBP07988 381 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 FAM27BQ5VT28 67 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 H3F3CQ6NXT2 135 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 DTX1Q86Y01 620 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MICU1Q9BPX6 476 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ULBP2Q9BZM5 246 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 ZNF700Q9H0M5 742 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 HKR1P10072 659 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 IL11RAQ14626 422 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 NAT6Q93015 286 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 NTNG2Q96CW9 530 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 TAF9BQ9HBM6 251 aa24.46■■□□□ 1.51
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa24.45■■□□□ 1.5
UBP1-201ENST00000283628 GABRR1P24046 479 aa24.45■■□□□ 1.5
UBP1-201ENST00000283628 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBP1-201ENST00000283628 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms