RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ETFDHQ16134 617 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TREM2Q9NZC2 230 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PRRT4C9JH25 899 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GPANK1O95872 356 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ZXDAP98168 799 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FRG2CA6NGY1 282 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CST7O76096 145 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DGCR2P98153 550 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DOK5Q9P104 306 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FZD6O60353 706 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR2A25A4D2G3 310 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OPN1MWP04001 364 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GFERP55789 205 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SPINK9Q5DT21 86 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CD40P25942 277 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CCR5P51681 352 aa14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GNG3P63215 75 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR2T2Q6IF00 324 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CXorf58Q96LI9 332 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1B0GTQ1 180 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PR80 420 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FGF2P09038 288 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLC17A1Q14916 467 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C2orf50Q96LR7 162 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ACER3Q9NUN7 267 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 COA4Q9NYJ1 87 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 C3orf80F5H4A9 247 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 J3KRW8 73 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TMPRSS2O15393 492 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ORM2P19652 201 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ACSM5Q6NUN0 579 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PN81 502 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 A0A1W2PNV4 684 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CHRNA7P36544 502 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC190Q86UF4 302 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MVB12AQ96EY5 273 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GPR87Q9BY21 358 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 H3BVH4 76 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.045e-8■■■□□ 19.2
LAMC1-201ENST00000258341 OR3A4PP47883 348 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 AFMIDQ63HM1 303 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ICMTO60725 284 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 SP1P08047 785 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 PLAURQ03405 335 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CA13Q8N1Q1 262 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FCGR3BO75015 233 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GCAP28676 217 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.79□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 MED12Q93074 2177 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HELTA6NFD8 242 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 K7ESF4 209 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RHOFQ9HBH0 211 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM129A0AVI4 362 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 HTR1DP28221 377 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 LIPAP38571 399 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 AUP1Q9Y679 476 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 ABLIM3O94929 683 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FABP4P15090 132 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DPTQ07507 201 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 Q8IYB0 196 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 RREB1Q92766 1687 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FAM24AA6NFZ4 105 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 IGHV3-13P01766 116 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 IGHV3-7P01780 117 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 CA6P23280 308 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 DIO1P49895 249 aa14.78□□□□□ -0.04
LAMC1-201ENST00000258341 FAM53BQ14153 422 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms