RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 OR1D4P47884 311 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FHITP49789 147 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PPT1P50897 306 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP5Q01469 135 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACY1Q03154 408 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SKP2Q13309 424 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GGTLC2Q14390 218 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ISXQ2M1V0 245 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01620Q4KN68 170 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 XKRXQ6PP77 449 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZRG5 221 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZVQ6 151 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UBALD2Q8IYN6 164 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GATSQ8NAP1 163 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT14Q8NB59 555 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5W2Q8NH69 310 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF563Q8TA94 476 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF721Q8TF20 911 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TSLPQ969D9 159 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM203Q969S6 136 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OMA1Q96E52 524 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX5Q99593 518 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TEAD3Q99594 435 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF649Q9BS31 505 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SRRQ9GZT4 340 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TPK1Q9H3S4 243 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RERGLQ9H628 205 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MED20Q9H944 212 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 APMAPQ9HDC9 416 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCB9Q9NP78 766 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 POLE4Q9NR33 117 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LRP12Q9Y561 859 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GYH0 126 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACACBO00763 2458 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP12A6NFH5 140 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A8MU76 341 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAC2D3DTV9 90 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BTX0 84 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QLW9 94 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ARPC3O15145 178 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 YKT6O15498 198 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF208O43345 1280 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN2O60636 221 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC19A2O60779 497 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ICOSLGO75144 302 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RENP00797 406 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FCER2P06734 321 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMD1P0DJR0 217 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTBP11277 2137 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IL7P13232 177 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CPN1P15169 458 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FOLR1P15328 257 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF19P17023 458 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms