RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561036.1

HDDC3-206, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDDC3, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-206ENST00000561036 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.75□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PXT1Q8NFP0 134 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 GPX8Q8TED1 209 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 AQP3Q92482 292 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 POM121Q96HA1 1249 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 METTL9Q9H1A3 318 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 POFUT1Q9H488 388 aa14.75□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.75□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 A0A1W2PR80 420 aa14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 ZNF35P13682 527 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 RAC2P15153 192 aa14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 UCP2P55851 309 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ACTBP60709 375 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ACTG1P63261 375 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PRDX4Q13162 271 aa14.74□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PLA1AQ53H76 456 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ACBD4Q8NC06 268 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 TM2D1Q9BX74 207 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 IL36GQ9NZH8 169 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 FRYQ5TBA9 3013 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 A0A0G2JNJ9 132 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MEIOCA2RUB1 952 aa14.73□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 CSF1P09603 554 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 RAD52P43351 418 aa14.73□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 PRSS12P56730 875 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 ARL6IP1Q15041 203 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.73□□□□□ -0.05
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HDDC3-206ENST00000561036 MTFR2Q6P444 385 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 SSX8Q7RTT4 187 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 TMEM104Q8NE00 496 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 SEH1LQ96EE3 360 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 KLK11Q9UBX7 282 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 Q9UFV3 132 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 AGFG2O95081 481 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CECR9P0C854 216 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PTHLHP12272 177 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MGMTP16455 207 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PLA2G5P39877 138 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 VEGFCP49767 419 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 RSU1Q15404 277 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CDNFQ49AH0 187 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CADM3Q8N126 398 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CHST4Q8NCG5 386 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MUCL1Q96DR8 90 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 GAL3ST1Q99999 423 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 OR10A4Q9H209 315 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 BANF2Q9H503 90 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-206ENST00000561036 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
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