RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	FPR2	P25090	351 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NTF4	P34130	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CCR6	P51684	374 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF117	Q03924	483 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	AES	Q08117	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	DLG1	Q12959	904 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	SELENBP1	Q13228	472 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAB31	Q13636	194 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GTF2H2	Q13888	395 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CD226	Q15762	336 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	EMB	Q6PCB8	327 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM107	Q6UX40	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR4C3	Q8NH37	302 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PIGX	Q8TBF5	258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM56	Q96MV1	263 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAB40C	Q96S21	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GPR22	Q99680	433 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	DOK1	Q99704	481 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ADI1	Q9BV57	179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	UPK1A	O00322	258 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	DLGAP1	O14490	977 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PIAS1	O75925	651 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBOX5	O94941	541 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	MPZL1	O95297	269 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CRYAA	P02489	173 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	SERPINE2	P07093	398 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RRAS	P10301	218 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GABRA3	P34903	492 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NAAA	Q02083	359 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TEK	Q02763	1124 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	BNIP2	Q12982	314 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TRAF3	Q13114	568 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CDK10	Q15131	360 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZAR1	Q86SH2	424 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NRM	Q8IXM6	262 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR2L13	Q8N349	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NUP37	Q8NFH4	326 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRAP	Q8TCY5	172 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	APH1B	Q8WW43	257 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TXNDC15	Q96J42	360 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RSG1	Q9BU20	258 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ABHD6	Q9BV23	337 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NIT2	Q9NQR4	276 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	C1orf109	Q9NX04	203 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GLTP	Q9NZD2	209 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAB26	Q9ULW5	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NFU1	Q9UMS0	254 aa		6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A1W2PQD3	144 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM129	A0AVI4	362 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	AGAP5	A6NIR3	686 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSTD3	H0UI37	97 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	CLDN34	H7C241	214 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	TIMM23	O14925	209 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLPP2	O43688	288 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	KNG1	P01042	644 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	HPX	P02790	462 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	ADRA2A	P08913	450 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	PET100	P0DJ07	73 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	NPR2	P20594	1047 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	OMG	P23515	440 aa		6.53	□□□□□ -1.36
NPIPB4-215	ENST00000542133	GNRHR	P30968	328 aa		6.53	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms