RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	GPR176	Q14439	515 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PFDN1	O60925	122 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RBBP9	O75884	186 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	KDM4B	O94953	1096 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CST4	P01036	141 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SELE	P16581	610 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RAD52	P43351	418 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	QRFP	P83859	136 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	GAL3ST1	Q99999	423 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610		A8MXE2	369 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610		J3QKU1	62 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SULT1C2	O00338	296 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	LANCL1	O43813	399 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ICMT	O60725	284 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	MPIG6B	O95866	241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CELA3B	P08861	270 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	NAT2	P11245	290 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	GDNF	P39905	211 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	UCP2	P55851	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PRSS12	P56730	875 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PPP1CB	P62140	327 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CHST4	Q8NCG5	386 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR52I2	Q8NH67	350 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ORC5	O43913	435 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CDC14B	O60729	498 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SMPD2	O60906	423 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PRDX4	Q13162	271 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	UNC119	Q13432	240 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RSU1	Q15404	277 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RND1	Q92730	232 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610		Q9UFV3	132 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RFX2	P48378	723 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	VEGFC	P49767	419 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	RNF144B	Q7Z419	303 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ATG13-222	ENST00000534610	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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