RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM11P17152 192 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 P2RX3P56373 397 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CDC20BQ86Y33 519 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TMED6Q8WW62 240 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR5H15A6NDH6 313 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 BTBD17A6NE02 478 aa11.92□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 THBS3P49746 956 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SOX8P57073 446 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GREM1O60565 184 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RAB13P51153 203 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GNB2P62879 340 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa11.91□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR4D11Q8NGI4 311 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GPX8Q8TED1 209 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FFAR1O14842 300 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM127O75204 238 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ACKR3P25106 362 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP82Q8N141 532 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ST7LQ8TDW4 575 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PRRX2Q99811 253 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CA6P23280 308 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS12P56730 875 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FOXL2P58012 376 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PMS2CLQ68D20 193 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RFESDQ8TAC1 157 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 YIPF5Q969M3 257 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GALMQ96C23 342 aa11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 DHRS3O75911 302 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00303Q3SY05 128 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SLC35E1Q96K37 410 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 JTBO76095 146 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 HPP00738 406 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 H2AFB1P0C5Y9 115 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TECTBQ96PL2 329 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS23O95084 383 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC3BP05452 202 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CCL3P10147 92 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CCL2P13500 99 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PRDX4Q13162 271 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SSX1Q16384 188 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SSX2Q16385 188 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RTL8BQ17RB0 113 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PLA1AQ53H76 456 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 UCK1Q9HA47 277 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 A0A0A6YYJ9 748 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR2F2O95006 317 aa11.9□□□□□ -0.51
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HDLBP-241ENST00000487169 PTGFRP43088 359 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CRYBB2P43320 205 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 NPBWR1P48145 328 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 MMP15P51511 669 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR2F1Q13607 317 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 KCNIP4Q6PIL6 250 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC190Q86UF4 302 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 OR6X1Q8NH79 312 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 M1APQ8TC57 530 aa11.9□□□□□ -0.51
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf90Q96M02 699 aa11.9□□□□□ -0.51
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